בארבע קפיצות זמן - על רקע אירועים דרמטיים שמתרחשים ישראל, מההתנתקות עד מלחמת לבנון הראשונה - עוקב ערן בר-גיל אחרי שתי משפחות, שגרו בשכנות בבניין משותף בחולון. ניבה גידלה עם ילדיה גם את בן השכנים שהתייתם מאימו. שרגא בעלה הזכיר לו שוב ושוב שאינו בן המשפחה, וכאשר העביר את משפחתו למקום אחר, הקשר עם בן השכנים התנתק.
דרכי המשפחות נפרדו, אבל הזיכרונות המשותפים המשיכו להשפיע על כל אחת מהדמויות. בחלוף שני עשורים - בן השכנים כבר לאחר לימודי ארכיאולוגיה ועובד בתחומו, ניבה החליפה מקום עבודה, שרגא בעלה נמצא באפריקה ואין לדעת אם ומתי יחזור - מנסה הבת הקטנה גפן, סטודנטית לקולנוע, לקשור מחדש את החוטים שיצאו מפקעת אחת.
ריבועים פתוחים הוא סיפור על אהבה שאינה תלויה בדבר, על בחירה מוסרית והפרתה, על סודות ושקרים, על משפחות שיציבותן עלולה להתערער באחת.
