הם קוראים לו "הילד המוזר". הם אומרים שבלילה הוא מתחיל לעוף, שהוא יודע להטיל כישוף, הם אומרים שלעולם הוא לא נרדם, ולאף אחד אין אומץ ללכת לשם.
יונתן הוא סיפור רב עוצמה על קבלת האחר, על דעות קדומות ועל כוחה של חברות, שכתבה המשוררת וסופרת הילדים האהובה, זוכת פרס מפעל חיים של אקו"ם, חנה גולדברג, ואייר להפליא המאייר, בוגר בצלאל, נדב וייסמן.